本当の問題があるとしたら、
「GitHubが原因である」ようにみえる報道機関の能力不足と
それをみて「GitHubは危険なんじゃないか」と考える意思決定者の知識不足と、
「GitHubを禁止しよう」と言い出すんでははないかというぐらいに自分たちの声を聞いてもらえないのではないかという組織内の関係性や距離感にある気がします。

まともな業界知識を持つひとが普通にやっていたら、"GitHub禁止"なんて馬鹿げた結論にはいたるはずがないわけで、そうじゃないひとがいるのだとしたら、
そのひとを意思決定者に入れること自体が間違いでしょう。